小さいころは祖母の影響で演歌歌手になりたいと思っていました。
安室奈美恵さんに憧れていた藤本美貴さんは、「avex dream 2000」オーディションに参加しファイナリストの24名に入ったもののグランプリには選ばれませんでした。
翌年に「モーニング娘。第3回追加オーディション」に参加し、2001年に「新・美少女日記」で芸能界デビューを果たしました。

2003年にモーニング娘。に6期メンバーとして加入すると一気に人気になり初のソロコンサートツアー「藤本美貴 ファーストコンサートツアー2003春 MIKI①」も開催しました。

またモーニング娘。の他にカントリー娘。や松浦亜弥さんとのユニット「GAM」を結成し活動していました。

2007年に卒業した吉澤ひとみさんに変わりリーダーを引き継ぎました。
しかし、5代目リーダーに就任するもお笑いコンビ品川庄司の庄司智春さんとのデートが「FRIDAY」で報じられると自身の申し出でモーニング娘。を脱退しました。
リーダー在籍期間は25日間でした。

2009年にハロプロを卒業し、翌年の2010年にファッションブランド・goocyとのコラボレーション企画で、自身初のプロデュースブランドとして、「koko jack（ココジャック）」を立ち上げました。
その他にも自身のプロデュースによる「chiara（キアラ）着圧ストッキング」やブランド「九重」とのコラボレーションによる「藤本美貴×九重」を発売しています。
さらに、小倉毅（医学博士）との共同プロデュースで開発した「骨盤レギンス」「骨盤股関節ハイウェストガードル」を発売し、その商品は特許も取得しています。

プライベートでは、2009年に庄司智春さんとの婚約を発表するとアメリカ合衆国のハワイ州で結婚式を挙げ、結婚披露パーティをグランドプリンスホテル赤坂で挙行しています。
2012年には、第1子（男児）を出産、2015年に第2子(女児）、2020年に第3子（女児）を出産しています。

育児をしながら商品プロデューサー・ファッションモデル・司会・コメンテーターとして幅広く活動し、ママタレとしての地位を確立しています。

第35回 日本有線大賞 新人賞：「ロマンティック 浮かれモード」（2002年）
第41回 日本有線大賞 有線音楽賞：「置き手紙」（2008年）
第41回 日本作詩大賞 優秀作品賞：「置き手紙」（2008年）
第1回 日本作曲家協会音楽祭 2008奨励賞（2008年）
第12回 COTTON USAアワード Mrs.COTTON USA（2015年）
第9回ベストマザー賞2016（芸能部門）

藤本美貴さんの出身小学校は滝川市立東小学校です。

安室奈美恵さんに憧れて「歌う人」になとうと思ったそうです。
姉からは「お前がアイドルになれるわけない」と言われたが「絶対なってやる」と思ったそうです。
藤本美貴さんは4人兄弟でよく兄弟喧嘩を喧嘩をしていたようで、その喧嘩の激しかったエピソードをこのように明かしています。
「喧嘩で姉の髪を掴んで水道の蛇口に叩きつけ、姉の前歯が欠けた」「喧嘩に負けるとわざと大きな声で泣いておじいちゃんを味方につけた」だそうです。
インスタグラムでは、「喧嘩もいっぱいしたけど今でも仲良し」と投稿しています。

小学校では、バスケットボール部に所属し活発な女の子だったようです。

藤本美貴さんの出身中学校は、滝川市立明苑中学校です。
中学校ではバレーボール部に入部し、ポジションはセッターでレギュラーにも選ばれていたようです。
しかし、1年半で辞めています。

小学校からの夢である歌手になろうと2年生の時「avex dream 2000」のオーディションを受けました。
12万人の応募の中から最終選考の24人にまで残ったものの残念ながら最終選考で落ちてしまいました。

藤本美貴さんといえば「ミキティ」が愛称ですが、このミキティは中学の頃からよばれていました。
由来は藤本美貴さんがハローキティが好きで名前の後ろに「ティ」をつけようとなったそうです。
その愛称のおかげで2014年に行われたハローキティ誕生40周年の「SHIBUYA de Hello Kitty」のPR大使に起用されています。
また、庄司さんからのプロポーズはサンリオピューロランドで「等身大のハローキティ人形が指輪を手に出迎える」という演出でした。
さらに、結婚式のお色直しでもハローキティとともに登場するなど本当にキティちゃんが大好きなようです。

中学校を卒業した藤本美貴さんは、北海道赤平高等学校に進学しました。
しかし、2013年に中退しています。

2000年に「モーニング娘。第3回追加オーディション」に応募したものの最終合宿直前で落選してしまいました。
しかし、「将来性を高く評価したうえで、藤本を「レッスン生」に採用されています。
また「モーニング娘。のオーディションを受けたら落ちて、事務所の人からソロでの活動を提案されました。」とも明かしています。